No entanto, en 1940 o goberno francés refugou-se temporalmente na cidade, fuxindo de París antes da chegada das tropas alemás. Decenas de miles de refuxiados que fuxían do avance nazi dirixíronse a Bordés. Moitos deles afluíron ao consulado portugués desexando obter un visado de entrada a Portugal ou aos Estados Unidos, onde Sousa Mendes, o cónsul, se seguía as instrucións do seu goberno, distribuirían visados con parcimonia.
Aristides de Sousa Mendes aínda permanece cónsul de Bordés cando comeza a Segunda Guerra Mundial, e as tropas de Adolf Hitler avanzan rapidamente sobre Francia.