A partir da firma do contrato entre o [E1]Museo Histórico Nacional[/E1], a Asociación dos Amigos do Museo Histórico Nacional e a Caixa Económica Federal realizada o 26 de novembro de 2004, liberáronse recursos no valor de R$ 1.900.000,00 para o inicio da segunda fase das obras aínda en decembro de 2005.
Por determinación do presidente Epitácio Pessoa, o Pavilión albergou, en dúas das súas salas, o núcleo inicial do Museo Histórico Nacional.