text: 在計算生物學中，N50和L50是Contigs(重疊群)或腳手架長度的統計值。N50的計算方式類似於平均值或中位數，但是對長Contigs的權重更大。這種方法廣泛運用於序列組裝中，特別是在參考組裝草稿內的Contigs長度中。這種度量常被用來描述基因組裝配(有時還有其他裝配)的“完整性”。但它的本質是告訴你一些關於Contigs長度分佈的資訊。定義.N50.N50根據連續性定義裝配質量。按照序列長度的順序排列你的集合中的所有Contigs。首先是最長的Contigs，然後是第二長的Contigs，最後是最短的Contigs。然後，從一開始累加所有Contigs的長度，這樣您就可以得到最長的Contigs+第二長的Contigs+第三長的Contigs，以此類推，直到達到佔總裝配長度50%的數字，即為N50。N50可以近似的看作分佈質量一半的點：比N50長的所有Contigs的鹼基數於比N50短的所有Contigs的鹼基數在數值上是接近的。L50.L50定義為，在給定一組Contigs的情況下，長度總和佔基因組大小一半的最小Contigs數。
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metadata.title: N50、L50和相關統計學
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